Podpora na vybudování systému MAPIS byla poskytnuta v rámci Operačního programu Životní prostředí, Prioritní osa 5 – Omezování průmyslového znečištění a environmentálních rizik (ERDF), oblast podpory 5.1 – Omezování průmyslového znečištění. Podpora ze Státního fondu životního prostředí České republiky byla poskytnuta v režimu zákona č. 388/1991 Sb., o Státním fondu životního prostředí České republiky ve znění pozdějších předpisů.